MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 81968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_013851	GAT	2	6	177040	177045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939928
4003	NC_013851	CGC	2	6	177090	177095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939928
4004	NC_013851	GAA	2	6	177118	177123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939928
4005	NC_013851	GCG	2	6	177129	177134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939928
4006	NC_013851	GCC	2	6	177155	177160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939928
4007	NC_013851	GC	3	6	177185	177190	0 %	0 %	50 %	50 %	288939928
4008	NC_013851	GAT	2	6	177199	177204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288939928
4009	NC_013851	CTC	2	6	177217	177222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939928
4010	NC_013851	AGCG	2	8	177245	177252	25 %	0 %	50 %	25 %	288939928
4011	NC_013851	GAA	2	6	177259	177264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288939928
4012	NC_013851	GC	3	6	177424	177429	0 %	0 %	50 %	50 %	288939928
4013	NC_013851	GCG	2	6	177434	177439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939928
4014	NC_013851	CGT	2	6	177447	177452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939928
4015	NC_013851	TCG	2	6	177467	177472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939928
4016	NC_013851	GCC	2	6	177532	177537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939928
4017	NC_013851	CAG	2	6	177538	177543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939928
4018	NC_013851	GCG	2	6	177561	177566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939928
4019	NC_013851	TCGGCC	2	12	177575	177586	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	288939928
4020	NC_013851	GATG	2	8	177735	177742	25 %	25 %	50 %	0 %	288939928
4021	NC_013851	AGAT	2	8	177752	177759	50 %	25 %	25 %	0 %	288939928
4022	NC_013851	GTCG	2	8	177787	177794	0 %	25 %	50 %	25 %	288939928
4023	NC_013851	CCA	2	6	177825	177830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939928
4024	NC_013851	CG	3	6	177925	177930	0 %	0 %	50 %	50 %	288939928
4025	NC_013851	CGC	2	6	177955	177960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939928
4026	NC_013851	CGGT	2	8	177983	177990	0 %	25 %	50 %	25 %	288939928
4027	NC_013851	GAG	2	6	178031	178036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939928
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4030	NC_013851	GC	4	8	178101	178108	0 %	0 %	50 %	50 %	288939928
4031	NC_013851	TCA	2	6	178134	178139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939928
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4033	NC_013851	GCGCG	2	10	178236	178245	0 %	0 %	60 %	40 %	288939928
4034	NC_013851	GCAGG	2	10	178264	178273	20 %	0 %	60 %	20 %	288939928
4035	NC_013851	CGG	2	6	178293	178298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939928
4036	NC_013851	TCC	2	6	178322	178327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939928
4037	NC_013851	CGC	2	6	178383	178388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939928
4038	NC_013851	CCGCG	2	10	178407	178416	0 %	0 %	40 %	60 %	288939928
4039	NC_013851	GCC	2	6	178445	178450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939928
4040	NC_013851	CGT	2	6	178496	178501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939928
4041	NC_013851	CGG	2	6	178540	178545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939928
4042	NC_013851	CATC	2	8	178584	178591	25 %	25 %	0 %	50 %	288939928
4043	NC_013851	GTT	2	6	178593	178598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_013851	TTCG	2	8	178689	178696	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4045	NC_013851	CGT	2	6	178721	178726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_013851	TGC	2	6	178754	178759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939929
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4052	NC_013851	CGC	2	6	178916	178921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939929
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4054	NC_013851	CGG	2	6	179019	179024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939929
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4056	NC_013851	CAT	2	6	179220	179225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939929
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4062	NC_013851	CGC	5	15	179500	179514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939930
4063	NC_013851	TCG	2	6	179574	179579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939930
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4106	NC_013851	CG	3	6	181267	181272	0 %	0 %	50 %	50 %	288939932
4107	NC_013851	AGC	2	6	181273	181278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939932
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4110	NC_013851	CTT	2	6	181498	181503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288939932
4111	NC_013851	CGGGTG	2	12	181551	181562	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	288939932
4112	NC_013851	TTG	2	6	181626	181631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288939932
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4116	NC_013851	CTTC	2	8	181807	181814	0 %	50 %	0 %	50 %	288939932
4117	NC_013851	GC	3	6	181818	181823	0 %	0 %	50 %	50 %	288939932
4118	NC_013851	GTGG	2	8	181849	181856	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_013851	AGGC	2	8	181877	181884	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4120	NC_013851	CGC	2	6	181919	181924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_013851	CGGG	2	8	181930	181937	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4122	NC_013851	CAA	2	6	181955	181960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4245	NC_013851	GC	3	6	187021	187026	0 %	0 %	50 %	50 %	288939939
4246	NC_013851	CGA	2	6	187085	187090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939939
4247	NC_013851	GGA	2	6	187106	187111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939939
4248	NC_013851	GC	3	6	187226	187231	0 %	0 %	50 %	50 %	288939939
4249	NC_013851	CAA	2	6	187247	187252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288939939
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4283	NC_013851	CG	3	6	189065	189070	0 %	0 %	50 %	50 %	288939940
4284	NC_013851	AAGC	2	8	189113	189120	50 %	0 %	25 %	25 %	288939940
4285	NC_013851	CAT	2	6	189121	189126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288939940
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4300	NC_013851	CGA	2	6	189855	189860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939940
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4303	NC_013851	GC	3	6	190070	190075	0 %	0 %	50 %	50 %	288939940
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4343	NC_013851	AGC	2	6	191888	191893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939941
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4347	NC_013851	A	7	7	192200	192206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4348	NC_013851	CAGAGA	2	12	192252	192263	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4349	NC_013851	GGC	2	6	192368	192373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4350	NC_013851	CTC	2	6	192377	192382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4351	NC_013851	GAA	2	6	192383	192388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4352	NC_013851	CG	3	6	192391	192396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4353	NC_013851	CG	3	6	192423	192428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4354	NC_013851	GACAGG	2	12	192440	192451	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4355	NC_013851	CAA	2	6	192483	192488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4356	NC_013851	CGT	2	6	192492	192497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4357	NC_013851	TGA	2	6	192518	192523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4358	NC_013851	ACA	2	6	192560	192565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4359	NC_013851	TCC	2	6	192570	192575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4360	NC_013851	C	6	6	192622	192627	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4361	NC_013851	AGC	2	6	192676	192681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4362	NC_013851	GAG	2	6	192787	192792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288939942
4363	NC_013851	TCGC	2	8	192793	192800	0 %	25 %	25 %	50 %	288939942
4364	NC_013851	GCGT	2	8	192890	192897	0 %	25 %	50 %	25 %	288939942
4365	NC_013851	AG	3	6	192918	192923	50 %	0 %	50 %	0 %	288939942
4366	NC_013851	TCC	2	6	192964	192969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288939942
4367	NC_013851	GCC	3	9	192979	192987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939942
4368	NC_013851	GGC	2	6	193005	193010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939942
4369	NC_013851	CTG	2	6	193014	193019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939942
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4371	NC_013851	CGT	2	6	193110	193115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288939942
4372	NC_013851	C	6	6	193180	193185	0 %	0 %	0 %	100 %	288939942
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4380	NC_013851	CGA	2	6	193427	193432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939942
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4430	NC_013851	TCAAG	2	10	195639	195648	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4431	NC_013851	TCGA	2	8	195661	195668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4432	NC_013851	TCG	2	6	195675	195680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4490	NC_013851	GCG	2	6	197684	197689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4491	NC_013851	GAGCG	2	10	197700	197709	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4492	NC_013851	GCG	2	6	197712	197717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4493	NC_013851	GGC	2	6	197718	197723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288939944
4494	NC_013851	CCA	2	6	197731	197736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288939944
4495	NC_013851	CAG	2	6	197741	197746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288939944
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4497	NC_013851	TTG	2	6	197844	197849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288939944
4498	NC_013851	CG	4	8	197854	197861	0 %	0 %	50 %	50 %	288939944
4499	NC_013851	GCCG	2	8	197882	197889	0 %	0 %	50 %	50 %	288939944
4500	NC_013851	GCC	2	6	197912	197917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288939944

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